Lanzhou University of Technology Institutional Repository (LUT_IR)
基于复合物结构和网络拓扑特性的关键蛋白质识别算法 | |
卢鹏丽; 蔚京娟 | |
2022-04-15 | |
发表期刊 | 兰州理工大学学报
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ISSN | 1673-5196 |
卷号 | 48期号:02页码:97-106 |
摘要 | 关键蛋白质的识别有助于从分子水平上理解生命的活动过程,然而仅从拓扑特性角度来识别的关键蛋白质不够精准,因此为了提高识别准确率,结合复合物信息提出了确定蛋白质关键性的指标模型EIC,该模型是基于蛋白质复合物内的局部中心性特性以及网络的全局信息特性来考虑.使用DIP和MIPS两种蛋白质相互作用(PPI)网络作为实验数据集,选用“排序-筛选”方法、精准召回、折刀等评估方法,通过与现有方法DC、BC、EC、SC、LAC、NC以及UC作对比,实验结果表明EIC方法优于这些方法,能够提高预测关键蛋白质的准确率. |
关键词 | 蛋白质相互作用网络 关键蛋白质 蛋白质复合物 评估方法 |
URL | 查看原文 |
收录类别 | 北大核心 |
语种 | 中文 |
资助项目 | 国家自然科学基金(11861045,11361033) |
中图分类号 | Q811.4;O157.5 |
文献类型 | 期刊论文 |
条目标识符 | https://ir.lut.edu.cn/handle/2XXMBERH/158592 |
专题 | 兰州理工大学 |
通讯作者 | 卢鹏丽 |
作者单位 | 兰州理工大学计算机与通信学院 |
第一作者单位 | 计算机与通信学院 |
通讯作者单位 | 计算机与通信学院 |
第一作者的第一单位 | 计算机与通信学院 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 卢鹏丽,蔚京娟. 基于复合物结构和网络拓扑特性的关键蛋白质识别算法[J]. 兰州理工大学学报,2022,48(02):97-106. |
APA | 卢鹏丽,&蔚京娟.(2022).基于复合物结构和网络拓扑特性的关键蛋白质识别算法.兰州理工大学学报,48(02),97-106. |
MLA | 卢鹏丽,et al."基于复合物结构和网络拓扑特性的关键蛋白质识别算法".兰州理工大学学报 48.02(2022):97-106. |
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