酸性矿坑水中细菌多样性分析及极端嗜酸菌重金属抗性研究

题名	酸性矿坑水中细菌多样性分析及极端嗜酸菌重金属抗性研究
作者	罗文
学位类型	硕士
导师	冷非凡 ; 王永刚
答辩日期	2015
学位授予单位	兰州理工大学
学位名称	理学硕士
学位专业	生物化学与分子生物学
关键词	嗜酸菌化能自养重金属抗性高通量测序铁硫簇生物信息学分析
摘要	本研究从AMD及周边土壤中分离筛选极端嗜酸化能自养细菌15株，并研究了特殊功能菌株AGMY3和未知菌株AGMGU3的形态、最佳生长条件、能量代谢和经生理生化特征四个方面的理化性质以及重金属抗性；同时，通过 Illumina高通量测序方法，从OTU聚类、Alpha多样性、Beta多样性、物种分类和功能预测五个方面对4个地区样点5个混合样品的细菌群落组成结构、相似性以及功能组成进行分析；最后通过计算机软件，对嗜酸化能自养菌代表菌株嗜铁钩端螺旋菌中9种铁硫簇蛋白进行了生物信息学分析。
其他摘要	In this study, 15 strains of extreme eosinophilic autotrophic bacteria were isolated and screened from AMD. Morphology, optimal growth conditions, energy metabolism and classical physiological and biochemical characteristics of the special functional strain AGMY3 and the unknown functional strain AGMGU3 were studied. Physicochemical properties and heavy metal resistance was followed. At the same time, through the Illumina high-throughput sequencing method, five samples of four sites were analyzed: OTU clustering, Alpha diversity, Beta diversity, species classification, and functional prediction. The composition, similarity, and functional composition of the bacterial community were analyzed. Finally, bioinformatics analysis of 9 iron-sulfur cluster-related proteins in the representative strain Leptospirillum ferriphilum of autotrophic bacteria was performed by computer software.
页数	83
语种	中文
学号	152071010003
文献类型	学位论文
条目标识符	https://ir.lut.edu.cn/handle/2XXMBERH/103037
专题	兰州理工大学
作者单位	兰州理工大学
第一作者单位	兰州理工大学
推荐引用方式 GB/T 7714	罗文. 酸性矿坑水中细菌多样性分析及极端嗜酸菌重金属抗性研究[D]. 兰州理工大学,2015.