权限管理包括操作权限管理、访问权限管理、下载IP控制以及审核管理。其中操作权限管理用于控制注册用户在系统中的专题管理、审核以及提交等操作的权限；访问权限管理用于控制用户（包括匿名用户）对系统条目的访问及下载的权限；下载IP控制是从全局层面按IP地址对下载行为进行控制；审核管理是用于系统管理员从后台中止正在进行的审核工作流。
下面对各个权限的内容进行说明：
（1）专题管理
可以对编辑专题的基本信息、进行条目映射和提交者管理，可以对专题下的所有条目进行编辑。隐含提交条目、全文下载、在线浏览、元数据访问、专题访问权限。只能对某个注册用户分配专题管理权限，不可按用户组分配。
（2）审核
审核工作流包括三个步骤，分别是审核、审核/编辑元数据和编辑元数据。“审核”是指审核者仅可选择是否允许该条目发布，允许发布则条目发布成功，不允许发布则条目返回提交者的工作间。“审核/编辑元数据”是指审核者不仅可以进行审核操作，还可以在发布前对条目的元数据进行编辑。“编辑元数据”是指审核者仅可以在发布前对条目的元数据进行编辑，不能进行审核操作。
上述三个步骤是可选的，也是独立的，不同的步骤需要选择相应的用户进行操作，不选择任何用户相当于没有该审核步骤。仅可对注册用户设置审核权限。
（3）提交条目
可以向当前专题/文献类型提交条目，仅可对注册用户设置提交权限。用户提交条目能否编辑该条目取决于当前专题的设置。
（4）全文下载
可以下载当前专题/文献类型的条目全文，隐含在线浏览、元数据访问、专题访问权限。匿名用户组的全文下载权限隐含了所有用户组的全文下载权限。
（5）在线浏览
可以在线浏览当前专题/文献类型的条目全文，隐含元数据访问、专题访问权限。匿名用户组的在线浏览权限隐含了所有用户组的在线浏览权限。
（6）元数据访问
可以查看当前专题/文献类型的条目元数据，隐含专题访问权限。匿名用户组的元数据访问权限隐含了所有用户组的元数据访问权限。
（7）专题访问
可以访问当前专题的主页。匿名用户组的专题访问权限隐含了所有用户组的专题访问权限。