甜菜CBL基因的基因组鉴定以及盐胁迫下的表达模式

	甜菜CBL基因的基因组鉴定以及盐胁迫下的表达模式
	伍国强; 谢玲玲
	2020-11-08
会议名称	第十九届中国作物学会学术年会
页码	1
会议日期	2020-11-08
会议地点	中国湖北武汉
摘要	【研究背景】土壤盐碱、干旱、低温、高pH、低钾等非生物胁迫是制约植物生长发育的重要环境因子。植物不能迁移到更有利的环境,必须在原地应对非生物胁迫。因此,植物已经进化出一套精确的调控机制,在分子、细胞和生理水平上感知、传递和响应胁迫信号。逆境胁迫会导致钙离子浓度的变化,钙感受器之一的类钙调磷酸酶B亚基蛋白(CalcineurinB-like protein,CBLs)能够感知这种变化,并且能够特异性结合位于下游的靶蛋白CBL互作蛋白激酶(CBL-interacting protein kinase,CIPKs),构成CBL-CIPK信号系统。CBL-CIPK复合物已经被鉴定在植物响应胁迫机制中占有重要地位;【材料与方法】通过生物信息学手段,鉴定甜菜CBL家族成员序列信息。利用MEGA7.0程序进行多序列比对,分类并构建系统进化树。利用SMART程序、TMHMM2.0、MEME软件以及GSDS工具进行基因结构与保守基序分析。用MapInspect1.0软件确定BvCBLs在染色体上的定位。将4周龄的甜菜幼苗分别在0、50、100和150mmol/L的NaCl处理72h,再通过qRT-PCR技术进行盐胁迫处理下BvCBLs表达分析;【结果与分析】鉴定出7个甜菜CBL家族成员,基因结构预测表明BvCBLs均含有8—11个内含子。预测的BvCBLs除了BvCBL6有2个EF-hand之外,其他BvCBLs均含3个EF-hand功能域。通过甜菜与其他物种的系统发育树分析,将7个BvCBLs分为4类。已有研究表明AtCBL1/9与AtCIPK23相互作用调控AtAKT1调节K+的吸收,BvCBL5与AtCBL1/9同源性最近,同属于GroupⅢ,推测BvCBL5有与AtCBL1/9相似的功能。BvCBL1与AtCBL4在GroupⅣ分布,其保守序列同源性较高,BvCBL1可能与AtCBL4功能相似,但仍需进一步的实验验证。染色体定位显示BvCBL1定位于Chr1,BvCBL2定位于Chr3,BvCBL3定位于Chr4,BvCBL4和BvCBL5定位于Chr5。通过qRT-PCR技术进行盐胁迫下甜菜幼苗根和叶表达分析,结果表明,BvCBLs表达量随着处理浓度的增加而升高,在100mmol/L时达到了最高,150mmol/L时降低,但仍比0处理时的表达量高。与其他的BvCBLs相比,BvCBL4的表达量最高,推测BvCBL4可能在甜菜响应盐胁迫中起着重要作用;【结论】在成功鉴定的7个候选BvCBLs基因中,BvCBL4在100mmol/L的NaCl处理下显著表达,其他BvCBLs在100mmol/L Na Cl胁迫下略有表达。所有BvCBLs在叶中的表达量明显比根中要高。
关键词	BvCBL 基因组鉴定表达模式盐胁迫
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语种	中文
中图分类号	S566.3
会议类型	中国会议
文献类型	会议论文
条目标识符	https://ir.lut.edu.cn/handle/2XXMBERH/163142
专题	生命科学与工程学院
作者单位	兰州理工大学生命科学与工程学院
第一作者单位	生命科学与工程学院
推荐引用方式 GB/T 7714	伍国强,谢玲玲. 甜菜CBL基因的基因组鉴定以及盐胁迫下的表达模式[C],2020:1.